周口市中心医院拥有完善的医疗、教学、科研、预防、保健、急救体系。下设91个科室（其中行政后勤科室25个，门诊医技18个，）48个病区、57个护理单元。是新乡医学院、河南科技大学、河南医学高等专科学校等多家院校的教学实习基地，河南省肿瘤防治网络分中心、河南省心血管治疗网络分中心、中国胸痛中心周口分中心，国家卫计委脑卒中防治与筛查基地、周口市神经外科研究所、周口市肢体残疾康复中心、周口市肝病研究所、周口市呼吸研究所、周口市康复研究所均设在本院。2008年5月，院正式成为河南大学附属医院；同年，北京安贞医院心脏病治疗技术合作中心也在院正式挂牌；2009年被授予“全国百姓放心示范医院”称号；2013年3月，医院正式成为新乡医学院附属医院。随着专病专科业务的开展和先进医疗技术的引进，周口市中心医院开展了心脏直视手术、心脏介入、脑血管介入治疗、准分子激光治疗近视眼等业务，心脏搭桥手术、脑血管瘤夹闭治疗手术填补市级空白并在全省居于先进行列。同时，人工全膝关节置换、人工耳蜗、心脑血管造影、腹腔镜、关节镜、膀胱镜等技术也在临床广泛应用。周口市中心医院先后被河南省周口市委、市政府命名为“花园式单位”、“十佳医院”、“文明单位”；被河南省人事厅、卫生厅、中医管理局授予“河南省卫生系统先进集体”；被河南省卫生厅授予“医政工作先进项目单位”、“医院医改创新示范医院”、“河南省参合农民满意医院”、“河南省干部保健先进集体”、“全省援外医疗工作先进单位”；被河南省委授予“优秀基层党组织”称号；被河南省政府纠风办和卫生厅联合授予“政风行风先进单位”；连续三年被河南省卫生厅授予“医院管理年活动先进集体”；2007年被国家人事部、劳动部、中医药管理局联合授予“全国卫生系统先进集体”、2008年被河南省卫生厅评为“医院管理年及‘三优一满意’先进单位”和“三优一满意A级医院”；2013年被中华全国妇女联合会授予“三八红旗集体”荣誉称号；被团中央授予“年度工作成效突出且吸纳见习青年50人以上见习基地”称号。