德阳市口腔医院由原德阳市口腔疾病防治门诊部更名组建，1997年德阳市口腔医院与原德阳市机关医院合并为德阳市口腔医院，原德阳市机关医院31名事业编制人员其中25名并入德阳市口腔医院，贺登秋为医院院长。1999年启用“德阳市第三人民医院”名称，实行一套人马两块牌子，履行市级综合医院职责，享受综合医院待遇。同年成立了德阳市口腔研究所，在市区天山北路83号建立德阳市第三人民医院旌东社区卫生服务站，为群众提供医疗、预防、保健、健康教育、康复为一体的基层卫生服务，为全市推行社区卫生服务先行试点。2001马骏任德阳市口腔医院院长；2002年钟崇福任德阳市口腔医院院长；2002年德阳市第三人民医院第一届工会委员会成立；2003年泸州医学院批准德阳市口腔医院成为泸州医学院临床教学基地；2012年德阳市口腔医院新业务楼由澳门特区政府援建，建筑面积5348平方米。